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该剧选取了一个独特的故事切入点：一个身体被制成标本、独自在展厅生活了50年的白鱀豚灵魂“大白”，遇上了还未出生便意外死亡、对世界充满好奇的江豚灵魂，两个生命在相处与陪伴中，一幅长江画卷逐渐展开，他们各自生命中那些幸福、美好和难忘的瞬间，都让观众在对这些可爱的生物产生好奇与喜爱的同时，逐渐理解保护自然、尊重生命的意义。

这部剧以“长江大保护”为创作背景，运用了浪漫主义和超现实主义的方式进行表达，在编剧、导演马彦伟看来，故事越美好、越温暖，观众的心里就会越惋惜，“我想用这样的一种反衬的手法引发思考：我们该如何和地球上的其他物种进行相处？地球是我们共同的家园，我们都是地球的孩子。人的生活要多姿多彩，动物的生命同样需要多姿多彩，他们也有自己的生活，有自己的家庭、朋友。动物跟我们是一样的。让我们一同感其所感、哀其所哀。”

如果说《长江女神，你愿意做我的爸爸吗？》的故事是浪漫的，那么剧目中展现的科普知识和古诗词一定会让观众感叹“知识以一种意想不到的方式进入了我的脑海”。当观众走进剧场，最先注意到的就是舞台上的“大展柜”。舞美设计申奥用三组长方形的框架结构和一组黑切割幕结构配合多媒体，立刻把观众带进了“博物馆”。随着剧情的不断推进，一条条关于白鱀豚和江豚的知识都变得鲜活起来。

剧中的一个小高潮就是随着大白的讲述，长江中的生物都以“偶”的方式出现在舞台之上。中华鲟、长江鲟、白鲟、花鳗鲡、鲥鱼、胭脂鱼……每个角色既有自己特点的仿生感，又有阳光穿过水面照在鱼类身上的通透感。这种灵动的生命力让观众更直观地认识、了解长江中的各种动物，可谓是一次生动的科普课。为了表现水生生物的骨骼感，该剧人物造型设计、偶设计曹婷婷在偶的结构设计上非常用心，整体还带有一种空灵和淡淡忧伤的浪漫风格。